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Standards Catalog

By 2021-04-2011월 9th, 2021No Comments

1. Study Data Standards Catalog

 

연구 정보, 안전성 및 유효성을 입증하는 문서 및 데이터는 규제 기관 검토 과정에서 의문이나 질문을 받지 않게 완전해야 합니다. 불완전한 제출 자료는 최종 결과에 영향이 없을 수는 있지만 변경, 추가 자료 요청으로 승인에 지연을 불러올 수 있습니다. FDA, PMDA는 IND, NDA 등 자료 제출의 완전성을 위해 Data Standards를 Catalog에 명확히 제시하고 있습니다. Data Standards Catalog 에는 사용 가능한 Data Standards 와 용어집 정보가 포함되어 있습니다. Data Standards 예로는 SDTM, ADaM, define-xml 등이 있고, 용어집 예로는 CDISC Controlled Terminology, MedDRA, WHO Drug Dictionary 등이 있습니다. 아래 링크에서 FDA, PMDA에 최신 버전의 Data Standards Catalog 문서를 다운로드 할 수 있습니다.

 

  1. FDA : Data Standards Catalog v7.0 (March 15, 2021)
  2. PMDA : Data Standards Catalog (2019-11-01)

 

문서에는 사용 유형(예: IND, NDA, Clinical Dataset 등), 데이터 교환 표준(예: eCTD, ICSR, SDTM, ADaM 등), 데이터 교환 형식(예: PDF, XML 등), 지원 버전, 지원 시작/종료 날짜 등 정보가 있습니다. FDA Clinical Study Datasets의 사용 유형에 따르면, 현재(2021 년 04월 기준) SDTMIG Version 3.2 또는 3.3 교환 표준을 따라야 하고 Clinical dataset 은 XPT 포멧으로 제출되어야 합니다. SDTMIG 표준은 CDISC.org-SDTM 에서 확인하실 수 있습니다.

Table 1. FDA Data Standards Catalog v7.0

FDA 문서인 Study Data Technical Conformance Guide 에서는 IND 시점에 연구 데이터의 표준화 제출 계획을 Study Data Standardization Plan(SDSP)에 포함하고 지속적으로 업데이트 하는 것을 권고하고 있습니다. 이는 CDER, CBER, PMDA 제출 시 모두 적용되며 SDSP 문서는 Appendix 로 요청되고 있습니다. 글로벌 진출을 위한 신약이라면 개발 초기부터 Data Standards 와 용어집을 잘 파악하여 사용하는 것이 중요합니다. SDSP 양식은 다음 경로에서 SDSP 검색어로 다운 받을 수 있습니다.

  1. FDA : Study Data Standardization Plan
  2. PMDA : Attachment 8 검색하여 다운

 

Data Standards 및 용어집의 사용
Data Standards Catalog 중 SDTM 과 관련된 UNII, MED-RT, SNOMED CT, DUN, LOINC, CDISC Terminology, SDTM, define-xml 사용에 대해 알아보도록 하겠습니다.
Trial Summary(TS) 데이터를 저장하는 SDTM TS Domain에는 UNII, MED-RT, SNOMED CT, DUN 용어집이 사용됩니다.
Table 2. TS Domain Example
> UNII (Unique Ingredient Identifier)
임상시험용 의약품의 활성 성분을 분류하고 코드화 하며 FDA에서 유지 관리합니다. TS Domain 에서는 다음 매개변수에 대한 코드값을 제공할 때 사용해야합니다.
  • – TRT (Investigational Therapy or Treatment)
  • – CURTRT (Current Therapy or Treatment)
  • – COMPTRT (Comparative Treatment Name)

다음 경로에서 검색하실 수 있습니다.

UNII 검색

 

> MED-RT

임상시험용 의약품을 약학적으로 분류하고 코드화 하며 Department of Veterans Affairs/Veterans Health Administration에서 유지 관리합니다. TS Domain 에서는 PCLAS (Pharmacological Class) 매개변수에 대한 코드값을 제공할 때 사용해야합니다. MED-RT 및 아래 SNOMED-CT는 다음 경로에서 용어집 선택 후 검색하실 수 있습니다.

NCI 검색

 

> SNOMED-CT

SNOMED CT는 임상 결과, 증상, 상병, 처치, 신체구조, 유기체 등 다양한 분야의 용어집 입니다. TS Domain 에서는 다음 매개변수에 대한 코드값을 제공할 때 사용해야합니다.
  • – INDIC (Trial Disease/Condition Indication)
  • – TDIGRP (Diagnosis Group)

 

> DUN

미국 연방 정부에 등록하는 데 필요한 모든 기업에 할당된 고유한 9자리 식별자입니다. TS Domain 에서는 SPONSOR(Clinical Study Sponsor) 매개변수에 대한 코드값을 제공할 때 사용해야합니다. 다음 경로에서 검색하실 수 있습니다.

DUN 검색

 

> LOINC

FDA는 실험실검사 항목의 수집 및 교환 방법을 개선하기 위해 LOINC를 2020년 3월 15일 부터 의무화하였습니다. 실험실검사는 동일 항목(WBC, RBC 등)이라도 단위, 시료, 검사방법 등에 따라 세분화되므로 LOINC 용어집으로 코딩하여 실험실검사 항목을 명확히 해야 합니다. 실험실검사 항목은 LOINC 홈페이지에서 검색하여 LB Domain에 코드값을 제공해야 합니다.
Table 3. LOINC 검색 화면
원시 데이터(Legacy Data or Raw Data)는 CDISC Controlled Terminology 로 코딩하여 변환하고, SDTM 규칙에 따라 정해진 Domain에 저장합니다(예: 키, 몸무게는 VS(Vital Signs) Domain에 저장). 제출 데이터가 SDTM으로 변환되면, 데이터의 설명서에 해당하는 define-xml을 생성합니다.
> CDISC Controlled Terminology
SDTMIG 에는 수집 데이터 중 CDISC Controlled Terminology 코딩이 필요한 항목을 표시하고 있습니다. 예를 들어, 성별이 그 중 하나이며 수집된 데이터는 SEX codelist에 F, M, U, UNDIFFERENTIATED 값으로 모두 코딩하여 제출해야 합니다. 문서 내에서 Codelist 확장 여부를 확인할 수 있고, 확장이 가능한 경우 동의어를 모두 확인하여 코딩할 값이 없다면 추가하여 사용할 수 있습니다. 다음 경로에서 CDISC Controlled Terminology를 다운 받으실 수 있습니다.
Table 4. CDISC Controlled Terminology for Sex Codelist
> SDTM
원시 데이터는 SDTMIG의 정의 및 규칙에 따라 Special Purpose, Interventions, Events, Findings Domains에 변환되어 저장하여야 합니다. 국내에서 아직 필수로 지정되지 않아 전문가가 부족한 상항이며, DB Lock 이후 2개월 정도 소요되는 것으로 알려져 있습니다. SDTM Datasets 은 FDA Validation Rule을 Error 없이 통과해야 하며, 데이터의 설명서인 define-xml 과 변환과정 설명 및 이슈를 기록하는 cSDRG (Clinical Study Data Review Guide) 와 함께 제출되어야 합니다. SDTMIG 는 현재 버전 3.4 까지 출시되었지만 FDA Data Standards 에서 아직 지원되지 않고, 버전 3.3 을 최신으로 사용하여야 합니다.
> define-xml
데이터의 설명서인 define-xml은 어플리케이션 없이 어느 기기 에서도 열어볼 수 있는 xml 언어로 작성되어 있습니다. Pinnacle 21, OpenCDSIC에서 SDTM Datasets를 Upload 하여 생성하거나, SAS Toolkit을 사용하여 생성할 수 있으나 부분적인 지원이거나 사용이 어려운 점이 있습니다. define-xml 에서는 aCRF, cSDRG 등 문서를 열어볼 수 있어야 하며 데이터가 CRF의 어느 페이지에서 수집이 되었는지, 유도된 값이라면 어느 공식으로 유도되었는지도 링크되어 있어야 합니다. 검토자가 필요한 정보를 모두 포함해야 하며, 관련된 정보가 링크되어 있어야 합니다.
Figure. define-xml
imtrial Metadata Repository는 FDA, PMDA Standards Data Catalog에 준하여 수집항목 Concept (SBP, DBP 등)을 생성하고 업데이트 합니다. imtrial을 사용하면 FDA, PMDA에 IND, NDA 제출시 SDSP를 사전에 수립하고 업데이트 할 수 있으며, 데이터 lock 이 후 간단한 설정으로 SDTM, define-xml 이 자동생성 되어 데이터 제출까지 시간을 줄일 수 있습니다.

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